In seguito a una mutazione iniziano a nascere esseri umani dotati di poteri straordinari. Temuti e perseguitati dagli uomini "normali", gli X-Men vivono per lo più clandestinamente e iniziano a riunirsi intorno all'accademia segreta fondato da Charles Xavier. Ma c'è anche chi cerca di sfruttare i superpoteri per conquistare il mondo, come il cattivo Magneto.